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①選取的RNA序列不對；
②樣品中沒有表達互作的蛋白質(zhì)。
③互作蛋白濃度低，銀染圖肉眼觀察不到差異條帶。
④其他
更多建議：
①lncRNA序列前期驗證要完善；
②選擇相應蛋白質(zhì)表達量較高的組織或細胞樣品；
③體外轉錄選擇轉錄質(zhì)量高的試劑盒，操作過程避免Rnase的污染；
④保證RNA Pull-down實驗中探針標記以及探針與蛋白的結合充分進行（依據(jù)體外轉錄RNA的量，樣品裂解液蛋白濃度）；
⑤盡可能多將洗脫的蛋白電泳（同時可以避免顯色時間過長）
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